更新时间:2026-05-01
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“国产测序仪科研赋能与生态构建”主题沙龙活动探讨了国产测序仪的技术发展、应用现状及标准制定等问题,与会嘉宾就产学研协同及行业发展进行了深入交流。
2025年5月11-13日,第十八届中国科学仪器发展年会(ACCSI2025)在上海富悦大酒店盛大举行。5月12日下午,仪器信息别举办了“
”主题沙龙活动,全国卫生产业企业管理协会精准医疗分会、全国卫生产业企业管理协会转化医学分会、深圳市真迈生物科技有限公司为活动的支持单位。沙龙活动采取报告+闭门座谈形式,30余位来自高校、科研院所、大型生命科学公共技术平台、海关系统、疾控系统、计量和测试技术研究单位、国产测序上游企业、生物技术企业等的各界代表受邀出席了本次沙龙活动。
、深圳市真迈生物科技有限公司总裁周志良分别作了测序技术主题分享,该环节由全国卫生产业企业管理协会精准医疗分会副会长袁旭军主持。
通过液滴微流控技术使用单细胞组合索引测序是一种在成本、可扩展性、鲁棒性和可及性之间取得平衡的理想方法。然而,现有的方法通常需要针对不同的检测模态单独优化实验方案,这限制了其自动化潜力和临床应用价值。为了解决这个问题,蒋岚团队开发了 UDA-seq通用流程,它整合了一个索引后步骤以提高通量,并系统地适应现有的基于液滴的单细胞多模态方法。UDA-seq 在各种组织和细胞类型中进行了基准测试,能够支持几种常见的多模态分析,包括 RNA 和适应性免疫受体库(AIRR)、RNA 和染色质以及 RNA 和 CRISPR 干扰的单细胞联合检测。值得注意的是,UDA-seq 在单通道液滴微流控实验中,能够从36份冷冻临床活检样本中高效生成超过 10 万个高质量的单细胞数据集。分析表明,这种方法在识别与临床表型相关的罕见细胞亚群以及探索癌细胞的脆弱性方面具有稳定性。相关技术成果受到北京大学乔杰院士和复旦大学金力院士等专家的高度认可。
基因测序仪是一种综合了光学、微流控、算法、半导体、化学、分子生物学等多种交叉学科的高端生命科学仪器平台。周志良结合基因测序仪的底层技术研发和国产化发展历程,介绍了国产测序仪利用底层技术平台为生命科学研究推动技术方法创新、应用场景开拓的解决方案和实际案例。周志良回顾道,自2015年起,真迈生物率先进入国产测序仪自主研发这一“无人区”,一入测序深似海,走过
漫漫测序仪底层技术的研发道路,直到最近5年才真正做到形成强竞争力,让用户用起来、用得好。他讲到,“此次因美纳事件,看似国产测序仪企业得了便宜,实则因果关系是反的:先是国产企业能力先建设起来,国家才有了制裁底气。在所有科学仪器国产替代进程中,测序仪是走在最前列的。如果想具备全球竞争力,国产测序仪也一定要走向全世界。”真迈生物测序仪采用的是可逆末端终止法测序技术路线,在行业内具有技术先进性,目前,线多台测序仪。
illumina被中国商务部列入《不可靠实体清单》,一个月后商务部宣布禁止该公司向中国出口基因测序仪。这一事件对国产测序仪无疑注入了强劲的发展动能,加速了国产替代进程并重塑市场格局。然而,illumina的测序仪在中国市场占比毕竟超过70%,被禁后将对各研究领域用户的影响仍是一个值得讨论的话题。因此,报告结束后,三十余位嘉宾就事件影响、国产测序仪在新兴科研、公共卫生及海关防控等领域应用现状、国产测序仪相关标准制定现状及挑战、产学研多方如何协同以促进行业发展等议题进行了深入交流,座谈环节由复旦大学陈力教授主持。座谈伊始,北京中检体外诊断工程技术研究中心康熙雄主任首先表达了对本次沙龙的认可。他表示深受两个报告启发,无论测序技术还是多组学技术都可以赋能他近几年所大力推广的健康评价体系——数字健康孪生的建设。设备功能化也是临床医学的一个需求趋势,未来一些技术不仅要成为基础的研究平台,还要再推进一步变成临床上功能化的平台,让临床医生更好地应用。
上海市生物医药技术研究院郑华军研究员自2001年开始就在国家人类基因组南方研究中心从事测序工作,已20余年,过程中体会颇深。“其实我们很早就希望能够有国产替代,进口测序仪成本很高,特别是维保费。”郑华军所在单位既是测序仪的使用者,也是测序服务提供者。从测序服务的角度,illumina事件会有影响,一方面是有用户对国产测序仪的认知不足,对测序质量有所担忧;另一方面是测序研究文章投稿时,部分杂志对更换的国产仪器会有疑问。值得欣慰的是,现在国产测序仪已经发了大量文章,并且已经在走国际化道路,大家共同努力,使用国产测序仪去做研究、发文章,国产仪器的认可度会越来越高。回国工作不久的王开乐研究员,现就职于中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,他原本担心国内测序仪和试剂价格高、测序结果不一定可靠,影响之前的研究继续开展。回国后了解到国产测序仪发展很好,并且真迈生物的测序仪平台与illumina技术路线一致,试过之后认为测序质量能够得到保证,因此因美纳事件对其研究工作影响较小。
单细胞测序与空间组学是测序技术在科研领域应用的两个极具潜力且备受瞩目的新兴方向。王开乐介绍,单细胞和空间组学研究增加了测序仪应用方向,单细胞测序和空间组学测序本质上还是测序,只是文库构建方式不同。空间测序本质上是空间标记,测序芯片是非常好的空间标记芯片。广州实验室基础研究部范小英研究员自2012年起长期从事单细胞测序技术的开发工作,过去十几年中一直使用进口测序仪,近几年国产测序厂商的试用机制是进行国产替代非常好的一种方式,国产厂商在与科研用户的对接方面做的更好。她认为,将二代测序应用到多组学研究中是非常好的思路,对于单细胞和空间组学基础科研而言具有极大推动作用。在单细胞多组学技术中,通量、准确度和测序长度,都需要考虑,如果二代测序能够达到kb级碱基测序水平,可以解决更多问题。
首都医学创新中心盛剑鹏研究员认为,当前测序仪的一个局限性在于通量和价格无法平衡,往往导致平台采购仪器后因样本量不够而闲置,也无法完成仪器使用率的考核。平台目前更倾向于寻求外部测序服务商的服务,但这一方面会增加测序周期,同时降低了部分实验数据的个性化。因此,平台期待同一台仪器上,不同芯片可实现不同功能,如同时进行甲基化测序和蛋白检测。北京中医药大学王铁山表达了相同观点。当前科研单位对于公共技术平台仪器计时率的考核非常严格,一台大型仪器一年的考核保准1500小时,因此高校采购仪器时需考虑能否真正使用起来。以空间转录组研究为例,全年测序量有限,不能支持仪器一直运转,因此同一台仪器能够兼容其他实验,对于高校购买测序仪会是极大助力。复旦大学上海医学院孙晓庆负责病原生物的测序平台,她谈到,外部供应商价格越卷越低,高校平台能生存,一方面依赖项目支持,另一方面通过技术方法的创新和改进获得更多老师的信任。高校没有服务商那样完整的部门分工,因此,国产测序仪如果想在高校推广,全流程服务和精准直指导十分必要。最后她也强调,价格和通量之间更好的平衡能让科研院所的测序平台更好的用起来。
珠海国际旅行卫生保健中心高级工程师汪海波表示,海关口岸作为基层应用单位一方面对测序试剂稳定性有更高要求,另一方面由于生信分析人员相对缺乏,希望国产设备在生信分析上除了前段的湿实验,后面的干实验部分也能够整合到测序仪系统中,做到一键分析。此外,设备现场化、小型化也是海关口岸场景的需求点。上海海关副主任技师张子龙补充,致病病原体检测是海关最重要的一个应用。样本存在量少、一次性采样,突发性事件多等特点,基于此,海关系统更需要高灵敏的试剂盒。此外,企业提供的试剂盒需要经得起多方评价和特定需求的改造。嘉兴市疾病预防控制中心微生物检验科科长/主任技师燕勇表示,相较于底层技术创新,基层单位更关心应用层面的技术创新,简单而言就是在人员有限的情况下,快速完成常规的基因检测工作。
上海市疾病预防控制中心 病原生物检定所 所长陈敏介绍,海关口岸是守国门,地方疾控是守护地方安全,对于政府实验室,检测工作不允许有任何一次错误的机会,因此仪器统一的标准方法非常重要。
中国计量科学研究院副主任董莲华研究员谈到,目前已经有相关的高通量测序仪的国际标准,国内标准制定要落后于新仪器的开发,这种现象具有双面性,因为标准制定如果太超前反而会制约仪器技术创新,因此标准制定的适用性和覆盖范围需要随着技术和仪器开发进程需要不断调整。各领域用户在使用测序仪时都希望它出的数据是准的,这是计量工作第一步。第二步是整个测序系统,包括仪器、试剂和软件的性能验证和确认的技术规范,在过去的计量溯源工作过程中发现国产测序仪性能指标不比进口仪器差,但是试剂和人员培训有时并没有同步发展,希望仪器厂商、试剂厂商快速发展起来,与标准制定部门共同去构建起生态。中国海关科学技术研究中心高级工程师王艺凯介绍,近两年,在超长期国债等国家政策推动下,首批支持的就是海关和公安系统,这个过程中存在虚假投标现象,以至于采购单位采买的仪器并非真正需要的,因此海科中心牵头制定了一个高通量测序仪性能评价的国家标准以规范整个采购流程。上海市计量测试技术研究院谈到,测序仪领域的计量校准基本是空白的,这种情况下,各级机构和质量标准机构要一起合作来制定出来。有几个方面需要重视的:第一,要积极组织行业比对,了解不同测序仪哪些关键指标还存在风险;第二,虽然标准规范还在报批阶段,但公开出具检测报告的实验室和生产方应该关注规范的报批稿,因为很多参数将要大面积开展计量校准过程涉及到,对仪器质量控制进行预演,准备好规范的发布执行。
中国测试技术研究院工程师姜展樾介绍,今年该单位承担了国产基因测序仪的计量测试评价项目,主要目的是通过对仪器的关键性能指标的测试评价,找出目前制约仪器发展的关键的问题,帮助实现技术突破。对于行政主管部门而言,这个项目能够产出一些数据,为后续政策制定提供相应数据支撑。对于测序仪应用方而言,这些测试评价能够给使用者一个客观、准确的参考。
北京航空航天大学副教授张大可认为,生态构建话题下,最大的障碍是数据共享。他表示,过去使用illumina平台时,很容易做找到公开发表的、可以下载的数据集作为参考,但是现在国产平台上很难找到可以验证的关键数据集,这是各方需要共同努力建设的。同时,希望真迈生物的国产数据集可以覆盖科研用户所关心等各种转化医学研究的应用场景。同济大学张晓鸥教授从事生物信息学研究,其中一个重要课题方向主要方向为转座子介导的基因表达调控机制研究。2020年回国后,他发现目前国内许多测序上游公司能够提供许多新的技术,这给其课题组算法研究带来新的机遇,机遇这些新的测序技术和方法能够支持他们开发原创性算法,去匹配下游应用,解决很多过去未能解决的问题。
中国科学院上海营养与健康研究所王振研究员讲到,测序除了仪器和试剂,还有软件部分。就像现在大多做单细胞测序的用户使用10X genomics也都用他们提供的软件,他们的软件做得非常标准化,刚上手的学生所测得的数据就很规范和完善,不会因为实验内容和实验人员的变化而需要重新建立实验流程。因此,他认为,在测序中软件标准化也应该是生态中的一部分。
对于生态构建这个话题,上海交通大学赵明珠作了一个畅想:我们很快进入Web3.0的时代了,借助区块链的技术能够为我们这种科研的协同创新的话提供一些全新的解决方案。基因测序在这方面底子非常好的,很多国产厂商已经跻身全球的就是第一梯队,将来产业转换总归还是需要时间和耐心的,随着生物基因科技和数字文明的深度融合,我相信我们这一代有可能会见证基因测序行业从跟跑到领跑的一个跨越。周志良最后总结到,想要更好地构建测序领域生态,首先产学研几方需要经常有机会在一起讨论,专业上相互之间形成统一的语言,这样整个科研过程中大量资源的利用可以更高效;第二,产学研合作转化及流程成功落地,关键要有钱,钱到底从哪来?先是国家和政府对创新项目的
,最终大家还是要找市场要钱,找需求方要钱,短期如果没有市场产出,更多从国家重大项目上获取支持。
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